自動排屑機在已經固化的地基上用地腳螺栓和墊鐵精調自動排屑機主床身的水平，找正水平后移動床身上的各運動部件（主柱、溜板和工作臺等），觀察各坐標全行程內自動排屑機的水平變換情況，并相應調整幾何精度使之在允許誤差范圍內。使用的檢測工具有精密水平儀、標準方尺、平尺、平行光管等。
在調整時，主要以調整墊鐵為主，必要時可稍微改動導軌上的鑲讓機床自動運動到刀具交換位置（可用G28 YO ZO或G30 YO ZO等程序），用手動方式調整裝刀機械手和卸刀機械手相對主軸的位置。在調整中采用一個校對心棒進行檢測，有誤差時可調整機械手的行程，移動機械手支座和倒庫位置等，必要時還可以修改換刀位置點的設定（改變數控系統內的參數設定）。調整完畢后緊固各調整螺釘及刀庫地腳螺栓，然后裝上幾把接近規定允許重量的刀柄，進行多次從刀庫到主軸的往復自動交換，要求動作準確無誤，不撞擊，不掉刀。帶APC交換工作臺的機床要把工作臺運動到交換位置，調整拖牌站與交換臺面的相對位置，達到工作臺自動換刀時動作平穩、可靠、正確。
然后在工作臺面上裝上70~80％的允許負載，進行多次自動交換動作，達到正確無誤后再緊固各有關螺釘。仔細檢查數控系統和PLC裝置中參數設定值是否符合隨機資料中規定數據，然后試驗各主要操作功能、安全措施、常用指令執行情況等。例如，各種運動方式（手動、電動、MDI、自動方式等），主軸掛擋指令，各級轉速指令等是否正確無誤。在機床調整過程中，一般要修改和機床有關的NC參數，例如各軸的原點位置等修改和機床部件相關位置有關參數，如刀庫刀盒坐標位置等。修改后的參數應在驗收后記錄或儲存在介質上。
檢查輔助功能及附件的正常工作，例如自動排屑機的照明燈，冷卻防護罩盒各種護板是否完整；往切削液箱中加滿切削液，試驗噴管是否能正常噴出切削液；在用冷卻防護罩條件下切削液是否外漏；排屑器能否正確工作；自動排屑機主軸箱的恒溫能否起作用等。自動排屑機液壓設備是由機械、液壓、電氣、儀表等組成的統一體，分析系統的故障之前必須弄清楚整個液壓系統的傳動原理、結構特點，然后根據故障現象進行分析、判斷，確定區域、部位、以至于某個元件、液壓系統的工作總是由壓力、流量、液流方向來實現的，可按照這些特征找出故障的原因并及時給予排除。
造成故障的主要原因一般不外有三種情況一是設計不完善或不合理；二是操作安裝有誤，使零件、部件運轉不正常；三是使用、維護、保養不當。前一種故障必須充分分析研究后進行改裝、完善，后兩種故障可以用修理及調整的方法解決。
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